Licenciado em Administração Pública Regional e Local, com Pós‑graduação em Gestão Pública e Curso de Alta Direção em Administração Pública, todos ministrados pela Universidade do Minho. O percurso profissional de Fernando Canário está associado à gestão de instituições públicas e à formação profissional.
Ingressou no Instituto do Emprego e Formação Profissional, I.P. há mais de três décadas, tendo desempenhado funções de técnico e de dirigente, assim como outros cargos, em representação do IEFP noutras instituições, o que lhe permitiu um conhecimento intrínseco sobre a realidade portuguesa no domínio da formação profissional.
Integrou o Conselho de Administração do CFPIMM em novembro de 2014, tendo assumido, em regime de suplência, no período compreendido entre 2016 e 2018, o cargo de Presidente do Conselho de Administração.
Exerce, desde setembro de 2023, as funções de Diretor do CFPIMM